1970 yılı İstanbul Yüksek İslam Enstitüsü'nden mezun oldu. 1971 - 1972 dönem İstanbul Üniversitesi Edebiyat Fakültesi İngiliz Dili ve Edebiyatı Bölümü'nde bir yıl okudu.

1971 - 1975 yılları arası Beyoğlu Müftülüğü'nde İmam Hatiplik görevini yaptı. 1977 yılında da Erzurum Yüksek İslam Enstitüsü'nde Kelam Asistanı olarak çalışmaya başladı. Bir yıl sonrası Atatürk Üniversitesi İslamî İlimler Fakültesi'nde Kelam Anabilim Dalı'nda asistan oldu.

1982'de Ebû Ca'fer et-Tahâvî'nin Akîdesi ve Selef Akidesindeki Yeri teziyle doktorasını tamamladı.

 1985 yılı başında üniversiteden ayrıldı. Bir yıl süreyle Türkiye Diyanet Vakfı İslâm Ansiklopedisi'nde redaktör olarak çalıştı. 1987 yılında kısa bir süre ticaretle meşgul oldu. Aynı yıl Bağcılar Ebubekir Camii İlim ve Hizmet Vakfı'nda vakıf müdürü olarak eğitim ve öğretim hizmetlerini yürüttü. Bu süre içinde İstanbul 8. Dönem İl Genel Meclisi Üyesi sıfatıyla Eğitim Komisyonu Üyesi olarak görev yaptı.

Eylül 2012 tarihinde Yalova Üniversitesi İlahiyat Fakültesi Kelam Anabilim Dalı'nda Yrd. Doç. olarak göreve başlayan Arif Aytekin; Şubat 2013 yılında Trakya Üniversitesi İlahiyat Fakültesi'ne Kelam Anabilim Dalı'nda Yrd. Doç. olarak atanıp fakültenin Temel Bilimler Başkanlığını yaptı. Nisan 2014 yılında Doç. Dr., 20...yılında da Prof. unvanlarını aldı.